Com aproximadamente 20 aeronaves, o deck de voo exibe as mais variadas e únicas aeronaves no pais, desde o bombardeiro torpedo Avenger, uma das estrelas em combate no Intrepid durante a Segunda Guerra Mundial, até o A-12 Blackbird, o avião espião mais temível da Guerra Fria. Sua coleção reflete algumas das maiores conquistas na aviação militar.